上海香料研究所前身是由原食品工業部上海食品油脂工業公司于1956年7月籌建的香料工業研究室，開始在復興中路470號，同年10月遷至虹橋路850號開展科研工作。

    1956年12月香料研究室劃歸原食品工業部上?？茖W研究所領導，并遷至北京西路1320號，后又從北京西路遷至靖江路，虹橋路為中試工場。1959年遷至汾陽路138號。

    1960年香料研究室劃歸輕工業部上海食品科學研究設計院領導。

    1962年9月11日香料研究室單獨成立所——輕工業部香料工業科學研究所，由輕工業部和上海市科委雙重領導。

    1965年改名為第一輕工業部香料工業科學研究所。

    1969年10月6日“文革”期間，下放上海市，改名為上海日用化學工業研究所（業務方向也改為香料香精、表面活性劑和感光材料研究），由日化公司革委會領導。

    1978年11月改名為上海香料工業科學研究所，收歸為直屬上海市輕工業局領導。

    1979年4月研究所又恢復原名為輕工業部香料工業科學研究所，由輕工業部領導，隸屬輕工業部科學研究院。專門從事香料香精研究。

    1979一1994年在龍吳路137號建立中試和生產基地。

    1994年12月從汾陽路遷往龍吳路137號。

    1995年2月因輕工業部改為中國輕工總會，所名改為中國輕工總會香料研究所。

    1997年在市郊奉城收購占地10畝的化工廠，改造為香料所第二中試和生產基地。

    1999年7月1日香料所由事業單位轉制為科技性企業，同年10月更名為上海香料研究所，由原隸屬于國家輕工業局劃歸上海輕工控股（集團）公司。

    2000年11月香料所劃歸上海家化（集團）有限公司領導。

    2006年3月家化集團將香料所資產整體轉讓給上海應用技術學院，成為由上海應用技術學院領導的具有獨立法人資格的科技型企業。